国家基因组科学数据中心中医药分中心(中医药基因组科学数据中心)于2024年6月成立,旨在面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求,建立中医药生命组学与健康大数据开放共享与整合挖掘研究体系,研发中医药大数据前沿交叉与转化应用的新方法和新技术,为科研人员提供更加便捷、高效的数据获取途径,从而推动中医药的创新与发展。
科学研究
主要研究方向:
1.中医药基因组科学数据资源标准化体系;
2.中医药生命组学大数据底座建设;
3.中医药健康大数据生物语言基座模型;
4.中医药前沿交叉智能计算平台。
特色数据资源:
1. 中医四诊客观化信息数据(健康人、孕妇、慢病患者);
2. 中医特色临床疾病的证候病人生物样本蛋白质组、代谢组数据资源;
3. 中医药基础研究疾病动物模型器官蛋白质组、代谢组、转录组及质谱成像数据资源;
4. 药用动植物的叶绿体(线粒体)基因组,核基因组、基因注释、比较基因组、转录组、蛋白结构组、代谢组、名贵中药种质的重测序等特色数据资源。
特色数据库
https://ngdc.cncb.ac.cn/cgir | https://ngdc.cncb.ac.cn |
整合药用植物组学平台 | |
http://www.bic.ac.cn/IMP |
信息服务
一、多组学数据整合分析
关键词:多组学整合
1、转录组差异基因筛选及功能富集分析:差异基因计算、主成分分析(PCA)、数据可视化
(聚类热图;火山图;箱式图),包富集分析,基因/蛋白功能富集分析等。
2、多组学数据与临床预后分析:基因突变分析、在线预后分析、相关性分析及散点图制作等。
3、转录组与蛋白组整合分析:Venn 图制作、蛋白与蛋白互作关系预测、网络图构建与美化等。
4、蛋白组与代谢组整合分析:代谢物功能富集分析、pathway map制作等。
5、全转录组整合分析:各类RNA简介及ceRNA介绍、miRNA测序报告解读、circRNA测序报告解读、miRNA分析、lncRNA分析等。
二、基于生物信息学的靶点预测
关键词:靶点药物相互作用,药效靶点预测
1、分子对接预测药物靶点:根据受体活性位点与药物分子的性质和形状的互补性,调整受体活性位点柔性残基或药物的构象,计算对接时不同取向的药物与受体的相互作用能量来评估受体与配体的作用方式。
2、反向找靶:反向分子对接方法、基于生物活性谱图分析等。
3、超高通量虚拟筛选:基于2D/3D结构相似性的虚拟筛选、基于药效团模型的搜索。
4、药物设计计算:药物衍生物库设计、ADMET、成药性预测、毒性分析、QSAR预测模型构建等。
三、计算化学个性定制服务
第一性原理 | 分子动力 | 量子化学 |
关键词:性质计算,周期性体系关键词:性质计算,周期性体系 | 关键词:生物机理,药物发现 | 关键词:反应机理,合成路径 |
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